Le château de Kežmarok a connu de nombreux propriétaires: Stephen, Imrich et Jean Zapolsky de 1462 à 1527, Jérôme et Albert Lasky de 1530 à 1531 et de 1532 à 1571, Jean Rueber de 1571 à 1577.
C’est la famille Thököly - Sebastian, Stephen I, Stephen II et Imrich - qui y a résidé le plus longtemps, de 1579 à 1670 et de 1678 à 1684. Stephen II Thököly et son fils Imrich se sont insurgés contre l'absolutisme de l'empereur. Après la répression de l'insurrection, l'empereur a confisqué tous les biens des rebelles, y compris le château de Kežmarok. Les expositions actuelles présentent la vie à Kežmarok et dans ses environs depuis les temps anciens jusqu’au début du XXe siècle.
Parmi les objets les plus précieux du musée figure un banc de prière marqueté, d´époque Renaissance, créé en 1544 par les maîtres de Kežmarok, Jean et Christophe Lang. A l'origine, le banc se trouvait dans l'église catholique de Ste Croix; plus tard, il a été transféré dans la chapelle du château. De nos jours, ce banc représente une illustration exceptionnelle de l’artisanat de l’époque. Cette oeuvre a représenté la Slovaquie à de nombreuses expositions d'arts et métiers dans le monde et a remporté d’importantes récompenses.